شرکت قارچ یکتای سپاهان از ابتدای فعالیت خود با تولید یک واحد تولید و پرورش قارچ در شهر محمدآباد جرقویه در سال 1382 با میزان تولید 400 تن در سال با هدف ایجاد زمینه های مساعد جهت رشد اقتصادی جامعه و ارتقا سطح اقتصادی و اجتماعی منطقه جرقویه سفلی شروع بکار کرد. در سال 1385 به دلیل لزوم رشد و توسعه  فعالیت اقتصادی شرکت و تاکید بر اشتغالزایی پایدار، با بهبود کیفیت و کمیت محصول قابل قبول و رقابتی  نسبت به راه اندازی واحد تولید کمپوست  مکانیزه قارچ  پس از تمام مجوزهای لازم اقدام و فعالیت خود را در محل جدید آغاز نمود.

روند رو به رشد و موفقیت های شرکت قارچ یکتای سپاهان موجب شد تا علاوه بر مدیران عالی شرکت که همگی در پی قالبی نو برای توسعه ی خدمت رسانی به مردم و مشتریان و تداوم موفقیت های آنان بودند،  سازمان جهاد کشاورزی استان اصفهان و سایر ارگان ها نیز از سوی دیگر خواستار حضور و فعالیت افزون تر شرکت در عرصه صنعت قارچ و کمک به توسعه بازار و حمایت ازآن شوند.